(1)2001年獲中國國家自然科學進步獎二等獎;
(2)2004獲美國宇航局局長簽署的“Cluster 科學作出突出貢獻”證
(3)2005獲歐洲空間局特殊貢獻獎;
(4) 2004、2007年歐洲空間局探測計劃科學成果的重要進展;
(5)研究成果《揭示太空殺手電子形成的秘密》入選美國著名的《發現》(Discover)雜志 2007年度的全球百大科技進展;
(6)2009年歐空局公布了雙星-Cluster計劃實施中具有突出貢獻的十位科學家名單,宗秋剛教授在全世界1000多名科學家中位居第一。
(7)2010年,獲得歐空局“傑出科學家”獎。
(8) 2012年美國地球物理協會優秀評審員
(9)2013年beat365優秀教師獎(方正)
(10) 2015年教育部自然科學二等獎